Amate Yuzuriha, ein Highschool-Mädchen, das in der Izuma-Kolonie lebt, lernt eine Kurierin namens Nyaan kennen.

Mitten im einjährigen Krieg zwischen dem Fürstentum Zeon und der Erdföderation ändert ein Vorfall auf Side 7 den Verlauf des Konflikts.

Amate trifft einen Jungen namens Shuji, der den Roten Gundam steuert. Sie kann das Gefühl des Glitzerns, das sie gemeinsam erlebt haben, nicht vergessen und schlägt vor, ein MAV zu gründen, um an dem Clan-Battle teilzunehmen. Amate beschließt, den Namen „MACHU“ als Startnamen zu verwenden.

Ein Unikum, die Hexe, das im Einjährigen Krieg über 100 Feinde abgeschossen hat, tritt im Clan-Battle an, um eine alte Rechnung mit dem Roten Gundam zu begleichen. Die Verbissenheit der Hexe, die sogar ihre Familie zurücklässt, um am Mobile Suit Battle teilzunehmen, führt Machu vor Augen, wie tief menschliche Rachegelüste greifen.

Machu plant, im Clan-Battle Geld zu verdienen und mit Shuji und Nyaan zur Erde zu reisen. Am Tag des Clan-Battles wird Machu jedoch von Xavier entdeckt und sitzt am Bahnhof fest. Wenn das so weitergeht, bleibt die Reise zur Erde nur ein Traum. In diesem Moment taucht Nyaan auf...

Annqi findet Shujis Versteck. Die Infos über den Roten Gundam sind mehr wert als das gesamte Preisgeld für ein Clan Battle. Machu erfährt, dass Annqi diese Informationen während eines Clan Battles verkaufen will. Der Geheimdienst der Erdföderation erfährt von Kycilias geheimen Infos und trifft eine Entscheidung.

Als Machu von Annqis Plan erfährt, denkt sie sich zusammen mit Nyaan einen Plan aus, um Shuji durch ein Clan Battle zur Flucht zu verhelfen. Aber ihr Battle-Gegner ist ein neuer Mobile Suit, der von Terroristen gesteuert wird, die Kycilia umbringen wollen.

Am Ende des Einjährigen Krieges startete die Sodon-Flotte unter Char, um zu verhindern, dass die Erdföderation die Festung Solomon zerstört und um die Mondstadt Granada zu schützen.

Eine mysteriöse Nachricht hilft Machu, von Sodon zu entkommen, und sie fliegt alleine im GQuuuuuuX zur Erde. Nach ihrer Bruchlandung wird sie von einer Frau gerettet, die als "Lady" verehrt und im Kabas-Anwesen gefangen gehalten wird. Machu beschließt, mit ihr im Core Fighter zu fliehen.

Um den Yomagn'tho von seiner Zerstörungswut abzuhalten, übernimmt Machu von Challia Bull den Auftrag, das Mädchen in der Rose retten. Doch Kycilia kommt ihr zuvor. Nyaans Mobile Suit, der GFreD, beginnt mit der Aktivierung der Zeknova-Kanone. Sein Ziel: die gesamte Menschheit auf der Erde.

Machu kämpft im GQuuuuuuX gegen Nyaan im GFreD und versucht gleichzeitig, das Rosenmädchen zu retten. Schließlich wagt sich Machu, von Shuji geführt, alleine ins Herz des Yomagn'tho. Dort trifft sie auf Char und Kycilia.