In der Nähe eines toten Sterns trifft die Enterprise auf ein Raumschiff, das von einem Parasiten befallen ist, der eine Gefahr für das ganze Schiff darstellt.
Spock muss in seine eigene Vergangenheit auf Vulkan zurückkehren, um seinen frühzeitigen Tod zu verhindern.
Die Besatzung der Enterprise muss sich beeilen, um eine Wolke aufzuhalten, die sich durch bewohnte Planeten ernährt.
Die Männer der Enterprise werden zum Opfer einer Rasse aus schönen Frauen, die unsterblich werden, indem sie Männern die Lebenskraft entziehen.
Cyrano Jones ist zurück – zusammen mit einer neuen Art von Tribbles, die sich angeblich nicht vermehren können.
Die Enterprise feiert die Rückkehr des vermissten Weltraumkaufmannes und Wohltäters Carter Winston. Doch der Schein trügt ...
Kirk und der Landetrupp treffen auf eine Rasse intelligenter Pflanzen und einen verrückten Wissenschaftler, der der Galaxie den Frieden bringen will.
Die Enterprise begibt sich ins Zentrum der Galaxie, wo die Besatzung auf mächtige Aliens trifft, die einst von der Erde geflohen sind.
Kirk kehrt auf den Landeurlaubsplaneten zurück, der jedoch nicht mehr ganz so friedlich scheint wie beim letzten Besuch der Besatzung.
Die Besatzung trifft erneut auf Harry Mudd, der diesmal einen angeblichen Liebestrank verkauft.
Die Mitglieder der Enterprise-Besatzung wurden starker Strahlung ausgesetzt und beginnen plötzlich, zu schrumpfen.
Die Enterprise und ein Schiff der Klingonen müssen zusammenarbeiten, um einer Tasche im Zeitgefüge zu entkommen, in der seit Jahrhunderten Schiffe gefangen werden.
Bei der Erkundung des Planeten Argo wachsen Kirk und Spock plötzlich Kiemen.
Spock, Sulu und Uhura werden von den Kzinti gefangen, die das Geheimnis um eine alte Waffe entschlüsseln wollen.
Auf der Suche nach einem vermissten Schiff werden Kirk, Spock und McCoy von telepathischen Kreaturen gefangen und in einen Zoo gesperrt.
Kirk und sein Team müssen so schnell wie möglich ein gestohlenes religiöses Artefakt aufspüren, bevor in der Galaxie ein heiliger Krieg entfacht wird.
Spock wird von einer für Vulkanier tödlichen Krankheit heimgesucht. Die Enterprise muss nun unbedingt ein Frachterschiff mit dem einzig möglichen Heilmittel erreichen.
Auf einer Erstkontakt-Mission bringt ein leichtsinniger Beobachter namens Bem Kirk und Spock in ernsthafte Schwierigkeiten.
Nachdem sie eine ungewöhnliche Wolke durchflogen haben, entwickelt der Computer der Enterprise eine verspielte und möglicherweise tödliche Persönlichkeit.
Dr. McCoy wird verhaltet und für den Ausbruch einer tödlichen Seuche auf dem Planeten Dramia II verantwortlich gemacht, wo er 19 Jahre zuvor ein Impfprogramm leitete.
Die Enterprise trifft auf eine Kreatur, die die Erde in der Antike besuchte und dort als der Maya-Gott Kukulkan bekannt wurde.
Die Enterprise versucht, ein nicht identifiziertes Schiff zu retten, wird jedoch selbst in ein Universum gezogen, in dem die Zeit rückwärts läuft.